1953年,芝加哥大學(xué)的研究生斯坦利·米勒拿起兩個長頸燒瓶——一個盛著一點水,代表遠古的海洋,一個裝著甲烷、氨和硫化氫的氣體混合物,代表地球早期的大氣——然后用橡皮管子把兩個瓶子一連,放了幾次電火花算作閃電。幾個星期以后,瓶子里的水呈黃綠色,變成了營養(yǎng)豐富的汁,里面有氨基酸、脂肪酸、糖以及別的有機化合物。
當(dāng)時的新聞報道聽上去讓人覺得,你只要把瓶子好好地晃一晃,生命就會從里面爬出來。
時間已經(jīng)表明,事情根本不是那么簡單。盡管又經(jīng)過了半個世紀的研究,今天我們距離合成生命與1953年的時候一樣遙遠——更不用說認為我們已經(jīng)有這等本事。
地球早期的大氣是一種很不活潑的氮和二氧化碳的混合物。
氨基酸的定義縮寫極結(jié)構(gòu)
有人用這些更具挑戰(zhàn)性的氣體重新做了米勒的實驗,至今只制造出一種非常原始的氨基酸。
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與多樣性
無論如何,其實問題不在于制造氨基酸,問題在于蛋白質(zhì)。
冠狀病毒的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
你把氨基酸串在一起,就得到了蛋白質(zhì)。這個過程需要大量的蛋白質(zhì)。
其實誰也不大清楚,但人體里的蛋白質(zhì)也許多達100萬種,每一種都是個小小的奇跡。
按照任何概率法則,蛋白質(zhì)不該存在。若要制造蛋白質(zhì),你得把氨基酸按照特定的順序來排列。
問題是那些以氨基酸字母組成的單詞往往長得不得了。若要拼出“膠原蛋白”(collagen,一種普通蛋白質(zhì)的名字)這個名字,你只需要以正確的順序排列8個字母。若要制造膠原蛋白,你就得以絕對準確的順序排列1055個氨基酸分子。但是這是個明顯而又關(guān)鍵的問題——你并不制造膠原蛋白。
膠原蛋白分子結(jié)構(gòu)
總之,蛋白質(zhì)是十分復(fù)雜的實體。血紅蛋白只有146個氨基酸分子長,按照蛋白質(zhì)的標準只是個矮子,然而即使那樣,氨基酸的排列方式也有10190種可能性。
血紅蛋白
想要隨隨便便地制造哪怕是一個蛋白質(zhì)分子也似乎是極不可能的,然而,我們在討論的蛋白質(zhì)有幾十萬種,也許是100萬種,就我們所知,每一種都別具一格,與眾不同,對于維持你的健康和幸福必不可少。
我們就從這里接著往下討論。為了被派上用場,一個蛋白質(zhì)分子不但要把氨基酸分子按照合適的順序排列起來,還要從事一種化學(xué)打褶工作,把自己疊成特定的形狀。即使實現(xiàn)了這種復(fù)雜的結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)分子對你依然沒有用處,除非它能復(fù)制自己,而蛋白質(zhì)分子不會。
為了達到這個目的,你需要DNA(脫氧核糖核酸)。DNA是復(fù)制專家——幾秒鐘就能復(fù)制一份自己,但除此之外沒有別的本事。
DNA結(jié)構(gòu)
于是,我們處于一種自相矛盾的境地。蛋白質(zhì)分子沒有DNA就不能存在,DNA沒有蛋白質(zhì)就無所事事。他們?yōu)榱嘶ハ嘀С侄瑫r產(chǎn)生的,這幾乎不可能。
DNA的復(fù)制過程結(jié)構(gòu)圖
還有,要是沒有膜把DNA、蛋白質(zhì)和別的生命要素包裹起來,它們也不可能興旺發(fā)達,原子或分子不會獨立實現(xiàn)生命。從你身上取下一個原子,它像一粒沙那樣沒有生命。
只有許多原子湊到一起,待在營養(yǎng)豐富的細胞里,這些不同的物質(zhì)才能參加令人驚嘆的舞會,我們稱其為生命。沒有細胞,它們只是有意思的化學(xué)物質(zhì)。但要是沒有這些化學(xué)物質(zhì),細胞就毫無用處。要是一切都需要別的一切,分子社會最初是怎么產(chǎn)生的?
細胞剖面結(jié)構(gòu)
好像你廚房里的各種原料不知怎的湊到一起,自己把自己做成了青椒煎蛋,必要的話,這塊煎蛋還會分裂,產(chǎn)生更多的煎蛋。所以,我們把生命稱為奇跡,這是不足為怪的。
不同種類蛋白質(zhì)
是什么促成了這神奇的復(fù)雜結(jié)構(gòu)呢?以那些不可思議的蛋白質(zhì)分子為例,我們假設(shè),我們所看到的奇跡般的排列,是在形成完畢以后才出現(xiàn)的。換句話說,要是蛋白質(zhì)不是一下子形成的,而是慢慢地演化的,那會怎么樣?請你想象一下,要是你把制造一個人的所有材料都拿出來——碳呀,氫呀,氧呀,等等,和水一起放進一個容器,然后用力搖一搖,里面就走出來一個完整的人,那將會是不可思議的。
肯定有某種日積月累的選擇過程,使得氨基酸聚集成塊狀。兩三個氨基酸分子也許為了某種簡單的目的聯(lián)結(jié)起來,一段時間以后撞在一起成為類似的小群體,在此過程中“發(fā)現(xiàn)”又有了某些改進。
大自然里許多分子聚在一起形成長長的鏈子,名叫聚合物。糖分子經(jīng)常聚在一起成為淀粉。
唐分子組成的淀粉分子結(jié)構(gòu)
整個宇宙里也許存在大量生命,也許不存在,但不乏有序的自發(fā)聚合。它存在于一切東西,從對稱的雪花到土星的美麗光環(huán)。
水分子遇冷形成雪花結(jié)晶體
大自然聚合事物是如此干勁十足,許多科學(xué)家現(xiàn)在認為,生命的出現(xiàn)比我們認為的還要不可避免。只要哪里條件合適,物質(zhì)的自發(fā)聚合勢必發(fā)生。很有可能,這樣的條件在每個星系里大約會遇到100萬次。
銀河系
當(dāng)然,在賦予我們生命的化學(xué)物質(zhì)里,沒有什么非常奇特的東西。要是你想制造另一個有生命的物體,無論是一條金魚,一棵萵苣,還是一個人,你其實只需要4種元素——碳、氫、氧和氮,加上少量幾種別的元素,主要是硫、磷、鈣和鐵。把30多種這些元素組成的化合物放在一起,形成糖、酸和其他的基本化合物,你就可以制造任何有生命的東西。而且關(guān)于制造有生命的東西的物質(zhì),也沒有什么特別的地方。有生命的東西都是分子的組合,與其他一切東西沒有兩樣。
紅腹錦雞
有關(guān)生命起源的許多細節(jié)現(xiàn)在依然難以解釋。你在書上讀到過的有關(guān)生命所必需的條件,每種情況都包括了水。到現(xiàn)在最普遍認為的生命始發(fā)地冒著氣泡的海洋噴氣口。但他們都忽視了一個事實:把單體變成聚合體包含一種反應(yīng),即生物學(xué)上所謂的“脫水縮合”,研究人員一致認為,由于質(zhì)量作用定律,在原始的大海里,實際上在任何含水的媒體里,這樣的反應(yīng)在能量方面是不大有利的。”這有點像把砂糖放進一杯水里,指望它結(jié)成一塊方糖。
砂糖
說了這么多我們只要知道這樣一點就夠了:要是你弄濕了單體,單體就不會變成聚合體——除了在制造地球上的生命的時候。
近幾十年來,地球科學(xué)方面有許多極其令人感到意外的發(fā)現(xiàn)。其中之一,發(fā)現(xiàn)在地球史早期就產(chǎn)生了生命。直到20世紀50年代,還認為生命的存在不超過6億年。到了70年代,幾位大膽的人士覺得也許在25億年前已經(jīng)有了生命。但是,如今確定的38.5億年確實早得令人吃驚。地球表面是到了大約39億年前才變成固體的。
40億年前地球表面模擬圖
實際上,生命出現(xiàn)得太快,有的權(quán)威人士認為這肯定有什么東西幫了忙——也許是幫了大忙。關(guān)于早期生命來自太空的觀點已經(jīng)存在很長時間,偶爾甚至使歷史生輝。
科學(xué)家認為生命的種子可能是隕石帶到地球上的。1969年9月的一個星期天,科學(xué)家在默奇森隕石里發(fā)現(xiàn),莫奇森隕石有45億年之久,上面星星點點地布滿著氨基酸——總共有74種之多,其中8種跟形成地球上的蛋白質(zhì)有關(guān)。隕石里還含有一系列復(fù)雜的糖,名叫多羥基化合物。這類糖以前在地球之外是沒有發(fā)現(xiàn)過的。
莫奇森隕石
宇宙里實際上存在著豐富的有機化合物?,F(xiàn)在認為,哈雷彗星的大約25%是有機分子。要是這類隕石經(jīng)常墜落在一個合適地方——比如地球,你就有了生命所需的基本元素。
哈雷彗星
說生命來自外太空是有問題的,它沒有回答生命是如何產(chǎn)生的這個問題,只是把責(zé)任推給了別的地方。
無論是什么事導(dǎo)致了生命的開始,那種事只發(fā)生過一次。這是生物學(xué)上最非同尋常的事實,也許是我們所知道的最不尋常的事實。凡是有過生命的東西,無論是植物還是動物,它的始發(fā)點都可以追溯到同一種原始的抽動。
生物進化過程圖
在極其遙遠的過去,在某個時刻,有一小囊化學(xué)物質(zhì)躁動一下,于是就有了生命。它吸收營養(yǎng),輕輕地搏動幾下,經(jīng)歷了短暫的存在。這么多情況也許以前發(fā)生過,也許發(fā)生過多次。但是,這位老祖宗干了另一件非同尋常的事:它將自己一分為二,產(chǎn)生了一個后代,一小袋遺傳物質(zhì)從一個生命實體轉(zhuǎn)移給了另一個生命實體,此后就這樣延續(xù)下去,再也沒有停止過。這是個創(chuàng)造我們大家的時刻。生物學(xué)家有時候?qū)⑵浞Q為“大誕生”。
地球早期多細胞生物
無論你到世界的什么地方,無論你看到的是動物、植物、蟲子還是難以名狀的東西,只要它有生命,它就會使用同一部詞典,知道同一個代碼。所有的生命都是一家。
我們都是同一遺傳戲法的結(jié)果。那種戲法一代一代地傳下來,經(jīng)歷了差不多40億年,到了最后,你甚至可以學(xué)上一點人類遺傳的知識,拼湊個錯誤百出的酵母細胞,真酵母細胞還會讓它投入工作,仿佛它是自己的同類。實際上,它確實是其同類。
酵母細胞
35億年前的地球。當(dāng)時,生命才剛剛起步。那個古老的年代在地球科學(xué)上叫作太古代。太古代有巨大的活火山,紅得刺眼的天空,下面有一個冒著水蒸氣的古銅色大海。前景的陰影里塞滿了一種細菌寄生的巖石,名叫疊層石。
疊層石
當(dāng)時的地球上與今天的火星上一樣沒有供我們呼吸的空氣。而且,地球上還充滿從鹽酸和硫酸中散發(fā)出來的毒氣,強烈得足以腐蝕衣服和使皮膚起泡。
太古代地球狀態(tài)
當(dāng)時的大氣里都是混濁的化學(xué)物質(zhì),陽光幾乎射不到地面。你只能借助經(jīng)常掠過的明亮的閃電,在短時間里看見有限的東西??傊覀儾粫J出那是我們自己的地球。在20億年時間里,細菌是唯一的生命形式。它們活著,它們繁殖,它們數(shù)量增加,但沒有表現(xiàn)出想發(fā)展到另一個更富挑戰(zhàn)性的生存層面的特別傾向。
細菌
在生命的頭10億年的某個時候,藻青菌,或稱藍綠藻,學(xué)會了利用大量存在的資源——存在于水中的特別豐富的氫。它們吸收水分子,吃掉了氫,排出了氧,在此過程中發(fā)明了光合作用。
藻青菌
光合作用無疑是本星球的生命史上所創(chuàng)造的最重要的新陳代謝方法”——光合作用是由細菌而不是由植物發(fā)明的。隨著藻青菌的增多,世界開始充滿氧氣,發(fā)現(xiàn)氧有毒的微生物深感吃驚——而在那個年代,那種微生物比比皆是。在一個厭氧的(或不使用氧的)世界里,氧是劇毒的。
需氧菌與厭氧菌對比圖
我們的白細胞實際上就是用氧來殺死入侵的細菌。氧從根本上說是很毒的,我們聽了往往會大吃一驚,因為許多人覺得呼吸氧是很舒服的事,但那只是因為我們已經(jīng)逐步進化到了能利用氧。
白細胞在工作
對于別的東西來說,它是一種可怕的東西。它使食物變質(zhì),使鐵生銹。連我們對氧的耐受力也是有限度的。我們細胞里的氧氣濃度,只有大氣里的大約十分之一。
刀表面是鐵銹(氧化鐵)
新的會利用氧的細菌有兩個優(yōu)勢。氧能提高產(chǎn)生能量的效力,它打垮了與之競爭的微生物。有的撤退到厭氧而泥濘的沼澤和湖底世界里;有的也照此辦理,但后來(很久以后)又移居到了你和我這樣的有消化力的地方。有相當(dāng)數(shù)量的這類原始實體此時此刻就生活在你的體內(nèi),幫助消化你的食物,但厭惡哪怕是一丁點兒氧氣。還有無數(shù)的其他細菌沒有適應(yīng)能力,最后死亡了。
常見厭氧菌種類
藻青菌逃跑并取得了成功。起初,它們所產(chǎn)生的額外的氧沒有積聚在大氣里,而是與鐵化合,成為氧化鐵,沉入了原始的海底。有幾百萬年的時間,世界真的生銹了,這個現(xiàn)象由條形鐵礦生動地記錄了下來。
鐵礦石
今天卻為世界提供了那么多的鐵礦石。在幾千萬年時間里,發(fā)生的情況比這多不了多少。但是,大約在35億年以前,更加堅強的東西變得顯而易見。只要哪里的海水很淺,可見的結(jié)構(gòu)就開始展現(xiàn)。在藻青菌完成慣常的化學(xué)過程的同時,它們開始帶有點兒黏性。那個黏性粘住了微小的灰塵和沙粒,一起形成了有點古怪而又堅固的結(jié)構(gòu)——淺水里的疊層石。
澳大利亞疊層石
疊層石有各種形狀、各種大小。疊層石有時候看上去像巨大的花椰菜,有時候又像毛茸茸的地墊,有時候,疊層石呈圓柱狀,戳出水面幾十米——偶爾高達100米。從各種表現(xiàn)形式來看,疊層石都是一種有生命的巖石。疊層巖代表了世界上第一個合作項目,有的種類的原始生物就生活在表面,有的就生活在下面,一方利用了另一方創(chuàng)造的條件。世界有了第一個生態(tài)系統(tǒng)。
疊層石
疊層石沒有光澤,灰色,看上去很像大團的牛屎。但是,望著地球上35億年前留下的生物,但這些晦暗的巖石上充滿了生命,據(jù)估計每平方米巖石上生活著36億個微生物。要是你看得仔細的話,你有時候能看到一串串小氣泡冒出水面。那是它們在釋放氧氣。在20億年時間里,這種小小的努力使地球大氣里的氧增加到了20%,為生命史的下一章,也是更復(fù)雜的一章鋪平了道路。
原始生命到復(fù)雜生命過程圖
生命為什么花了很長時間才復(fù)雜起來?原因之一是,世界不得不等待,直到簡單的生物已經(jīng)在大氣里充入了足夠的氧。地球花了大約20億年,即大約40%的地球歷史,大氣里氧的濃度才大體上達到了現(xiàn)在的水平。
現(xiàn)在的地球
但是,一旦條件成熟,顯然是在突然之間,一種嶄新的細胞出現(xiàn)了——那個細胞里含有一個核和幾個別的部分,統(tǒng)稱“細胞器”。該過程始于某個行為草率或敢于冒險的細菌。它不是受到了侵犯,就是被別的細菌俘虜。結(jié)果,雙方都感到很滿意。據(jù)認為,那個被俘的細菌變成了一個線粒體。
線粒體結(jié)構(gòu)
這種線粒體入侵(也稱作“內(nèi)共生事件”)使得復(fù)雜生命的出現(xiàn)成為可能。在植物方面,一次類似的入侵產(chǎn)生了葉綠體,使植物能進行光合作用。
線粒體支配著氧,釋放食物中的能量。沒有這種很有用處的戲法,今天地球上的生命不過是生活在污泥里的一大堆簡單的微生物。線粒體極小——一粒沙子大小的空間里可以裝上10億個線粒體,而且老是肚子餓,你吸收的營養(yǎng)到頭來都喂了線粒體。
要是沒有線粒體,我們兩分鐘也活不到。然而,即使過了10億年,線粒體的表現(xiàn)顯示,它們似乎依然認為我們之間的問題有可能解決不了。它們保持了自己的DNA、RNA(核糖核酸)和核蛋白體。它們與寄主細胞在不同的時候繁殖。它們看上去像細菌,像細菌那樣分裂,有時候?qū)股刈龀黾毦鷷龀龅哪欠N反應(yīng)。它們甚至不說寄主細胞說的那種基因語言。這很像是你家里來了個陌生人,而這個陌生人已經(jīng)在你的家里住了10億年。
DNA與RNA的不同螺旋結(jié)構(gòu)
新的種類的細胞被稱為真核生物(意思是“真具有核的”),與之相對的舊的種類的細胞被稱為原核生物(意思是“在具有核之前的”)。
真核細胞結(jié)構(gòu)圖
它們似乎突然出現(xiàn)在化石記錄里。已知的最古老的真核生物,即所謂的卷曲藻,是1992年在密歇根州的鐵沉積物中發(fā)現(xiàn)的。這種化石只發(fā)現(xiàn)過一次,接著在5億年中杳無蹤影。
藻類化石
地球已經(jīng)朝著真正有意思的行星邁出了第一步。與新的真核生物相比,舊的原核生物——借用英國地質(zhì)學(xué)家斯蒂芬·德魯里的話來說——不過是“幾囊化學(xué)物質(zhì)”。真核生物比它們比較簡單的堂兄弟要大——最少要大1萬倍,能夠多帶1000倍的DNA。由于這些突破,生命漸漸變得復(fù)雜,結(jié)果創(chuàng)造了兩種生物——排斥氧的(比如植物)和接受氧的(比如你和我)。
單細胞的真核生物一度被稱作原生動物,與之前的細菌相比,原生生物在模式上和復(fù)雜程度上都是個奇跡。簡單的變形蟲只有一個細胞大,除了生存沒有別的雄心壯志,但在它的DNA中包含著4億條遺傳信息。
變形蟲
最后,真核生物學(xué)會了一種更加獨特的把戲。這花去了很長時間——10億年左右,但它們一旦成為專家,那還是個挺不錯的把戲。它們學(xué)會了結(jié)合在一起,形成復(fù)雜的多細胞生物。由于這項新的發(fā)明,像我們這樣大而復(fù)雜的、可見的實體終于成為可能。
地球這顆行星已經(jīng)準備好進入下一個雄心勃勃的階段。但是,在為此感到過分激動之前,我們將會看到,世界還仍然是小生物的世界。
好了,生命起源簡析就寫到這里了